Чтобы данные из Copper автоматически попадали в Cdek, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию Copper и Cdek можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.