Сценарий по расписанию забирает новые файлы из KoBoToolbox и складывает их копии в KoBoToolbox. Резервная копия живёт сама.
Чтобы данные из GitHub автоматически попадали в KoBoToolbox, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Такой сценарий можно запустить в Scriptera: задача описывается обычными словами, сборка и запуск — на стороне сервиса.