Сценарий по расписанию берёт задачи из личного Moysklad и создаёт их в командном. Всё, что вы записали на бегу, доходит до команды.
Чтобы записи в Moysklad создавались из Clockify без ручного ввода, достаточно готового сценария.
Эту интеграцию Clockify и Moysklad можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.