Сценарий находит файлы в GitHub и сам создаёт метки в Git. Работает само, без ручного переноса.
Перенос данных из GitHub в Git делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Эту интеграцию GitHub и Git можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.