Перенос данных из Extract from File в Vk Cloud S3 делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Эту интеграцию Extract from File и Vk Cloud S3 можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.