Сценарий находит записи в Azure Cosmos DB и сам создаёт папки в Git. Работает само, без ручного переноса.
Перенос данных из Azure Cosmos DB в Git делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Настроить такую автоматизацию (Azure Cosmos DB + Git) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.