Сценарий находит записи в MySQL и сам создаёт пользователей в GitHub. Работает само, без ручного переноса.
Перенос данных из MySQL в GitHub делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Эту интеграцию MySQL и GitHub можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.