По назначенной задаче сценарий находит проект и заводит задачу и запись времени в трекере.
Чтобы записи в Clockify создавались из Jira Software без ручного ввода, достаточно готового сценария.
Настроить такую автоматизацию (Jira Software + Clockify) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.