Чтобы данные из Yandex Disk автоматически попадали в Jira Software, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию Yandex Disk и Jira Software можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.