Сценарий регулярно проверяет новые документы в Moysklad и копирует их в Pipedrive. Резервная копия делается сама.
Чтобы данные из Moysklad автоматически попадали в Pipedrive, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Такой сценарий можно запустить в Scriptera: задача описывается обычными словами, сборка и запуск — на стороне сервиса.