Сценарий регулярно проверяет новые документы в Moysklad и копирует их в Vk Cloud S3. Резервная копия делается сама.
Перенос данных из Moysklad в Vk Cloud S3 делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Такой сценарий можно запустить в Scriptera: задача описывается обычными словами, сборка и запуск — на стороне сервиса.