Перенос данных из Invoice Ninja в Mail Ru Biz делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Эту интеграцию Invoice Ninja и Mail Ru Biz можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.