Чтобы данные из Customer.io автоматически попадали в Bitrix24, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию Customer.io и Bitrix24 можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.