Чтобы заявки из Clockify сами попадали в Microsoft To Do, достаточно готового сценария — без ручного переноса и потерь.
Эту интеграцию Clockify и Microsoft To Do можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.