Чтобы данные из Customer.io автоматически попадали в Microsoft Excel 365, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию Customer.io и Microsoft Excel 365 можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.