Чтобы данные из Magento 2 автоматически попадали в Azure Cosmos DB, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Настроить такую автоматизацию (Magento 2 + Azure Cosmos DB) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.