Перенос данных из Invoice Ninja в Bitrix24 делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Эту интеграцию Invoice Ninja и Bitrix24 можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.