Чтобы данные из Invoice Ninja автоматически попадали в Yandex Metrika, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Настроить такую автоматизацию (Invoice Ninja + Yandex Metrika) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.