Перенос данных из Magento 2 в Freshdesk делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Эту интеграцию Magento 2 и Freshdesk можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.