Чтобы заявки из Formstack сами попадали в Extract from File, достаточно готового сценария — без ручного переноса и потерь.
Эту интеграцию Formstack и Extract from File можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.