Сценарий замечает появление папок в S3 и сам удаляет задачи в Moysklad. Работает само, без ручного переноса.
Чтобы данные из S3 автоматически попадали в Moysklad, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Настроить такую автоматизацию (S3 + Moysklad) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.