Чтобы данные из MailerLite автоматически попадали в Chargebee, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию MailerLite и Chargebee можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.