Чтобы данные из Azure Cosmos DB автоматически попадали в Affinity, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию Azure Cosmos DB и Affinity можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.