Чтобы данные из Omnidesk автоматически попадали в GitHub, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию Omnidesk и GitHub можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.