Чтобы данные из Mattermost автоматически попадали в Customer.io, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию Mattermost и Customer.io можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.