Сценарий замечает появление счетов в Magento 2 и сам создаёт счета в QuickBooks Online. Работает само, без ручного переноса.
Перенос данных из Magento 2 в QuickBooks Online делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Такой сценарий можно запустить в Scriptera: задача описывается обычными словами, сборка и запуск — на стороне сервиса.