Сценарий замечает появление счетов в Magento 2 и сам создаёт записи в Microsoft SQL. Работает само, без ручного переноса.
Перенос данных из Magento 2 в Microsoft SQL делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Настроить такую автоматизацию (Magento 2 + Microsoft SQL) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.