Сценарий замечает появление товаров в WooCommerce и сам создаёт документы в Moysklad. Работает само, без ручного переноса.
Чтобы данные из WooCommerce автоматически попадали в Moysklad, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Настроить такую автоматизацию (WooCommerce + Moysklad) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.