Сценарий замечает появление задач в GitHub и сам создаёт папки в Git. Работает само, без ручного переноса.
Чтобы данные из GitHub автоматически попадали в Git, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию GitHub и Git можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.