Перенос данных из Jira Software в Boxberry делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Эту интеграцию Jira Software и Boxberry можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.