На новый заказ в WooCommerce сценарий выставляет счёт в Magento 2 со всеми данными.
Интеграция WooCommerce и Magento 2 собирается из готового сценария — вот как он устроен по шагам.
Такой сценарий можно запустить в Scriptera: задача описывается обычными словами, сборка и запуск — на стороне сервиса.