Чтобы данные из ConvertKit автоматически попадали в Autopilot, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию ConvertKit и Autopilot можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.