Сценарий следит за базой клиентов и, как только там появляется новый, заводит его в системе учёта времени.
Чтобы записи в GitLab создавались из moysklad без ручного ввода, достаточно готового сценария.
Эту интеграцию moysklad и GitLab можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.