Чтобы данные из Stripe автоматически попадали в Microsoft Dynamics CRM, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию Stripe и Microsoft Dynamics CRM можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.