Сценарий замечает изменения проектов в jira и сам создаёт проекты в Clockify. Работает само, без ручного переноса.
Перенос данных из Clockify в Jira делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Эту интеграцию Clockify и Jira можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.