Сценарий замечает изменение остатков остатков в shopify и сам создаёт клиентов в Magento 2. Работает само, без ручного переноса.
Чтобы данные из Magento 2 автоматически попадали в Shopify, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Настроить такую автоматизацию (Magento 2 + Shopify) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.