Сценарий по расписанию забирает новые файлы с yandexDisk и пачками загружает их в selectelS3, сохраняя имена.
Чтобы данные из yandexDisk автоматически попадали в selectelS3, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Такой сценарий можно запустить в Scriptera: задача описывается обычными словами, сборка и запуск — на стороне сервиса.