Сценарий по расписанию забирает новые файлы с yandexDisk и пачками загружает их в yandexDisk, сохраняя имена.
Перенос данных из yandexDisk в делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Такой сценарий можно запустить в Scriptera: задача описывается обычными словами, сборка и запуск — на стороне сервиса.