Сценарий просыпается по расписанию и сам создаёт записи в Moysklad. Работает само, без ручного переноса.
Перенос данных из S3 в Moysklad делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Эту интеграцию S3 и Moysklad можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.