Чтобы данные из Vk Cloud S3 автоматически попадали в Microsoft SQL, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию Vk Cloud S3 и Microsoft SQL можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.