Сценарий по расписанию заходит на vkCloudS3, скачивает файлы и загружает их в S3, сохраняя ту же структуру папок, что и на исходном сервере.
Автоматизация vkCloudS3 и S3 не требует кода: готовый сценарий выполняет рутину сам.
Эту интеграцию vkCloudS3 и S3 можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.