Чтобы данные из Freshdesk автоматически попадали в MailerLite, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Эту интеграцию Freshdesk и MailerLite можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.