Перенос данных из Freshdesk в Flexbe делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Эту интеграцию Freshdesk и Flexbe можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.