Сценарий замечает удаление проектов в jira и сам создаёт записи в Stackby. Работает само, без ручного переноса.
Перенос данных из Stackby в Jira делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Настроить такую автоматизацию (Stackby + Jira) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.