Сценарий по расписанию забирает новые задачи из первого Moysklad и создаёт их копии во втором.
Чтобы записи в Moysklad создавались из GitHub без ручного ввода, достаточно готового сценария.
Настроить такую автоматизацию (GitHub + Moysklad) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.