Сценарий регулярно проверяет GitLab и переносит новые задачи во второй GitLab. Списки совпадают, ничего не теряется.
Чтобы данные из ClickUp автоматически попадали в GitLab, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Настроить такую автоматизацию (ClickUp + GitLab) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.