Сценарий регулярно проверяет Monica CRM и переносит новые задачи во второй Monica CRM. Списки совпадают, ничего не теряется.
Перенос данных из GitHub в Monica CRM делается готовым сценарием: он сам замечает новое и переносит его.
Настроить такую автоматизацию (GitHub + Monica CRM) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.