Сценарий регулярно проверяет Taiga и переносит новые задачи во второй Taiga. Списки совпадают, ничего не теряется.
Чтобы данные из GitLab автоматически попадали в Taiga, достаточно готового сценария — без выгрузок руками.
Настроить такую автоматизацию (GitLab + Taiga) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.