Сценарий по расписанию берёт новые задачи из одного Moysklad и создаёт их в другом. Один список дел, где вам удобно.
Чтобы записи в Moysklad создавались из Jira Software без ручного ввода, достаточно готового сценария.
Настроить такую автоматизацию (Jira Software + Moysklad) можно в Scriptera — без кода: опишите задачу, остальное сделают за вас.