Чтобы данные в GitHub и Stepik всегда совпадали, их связывает готовый сценарий — изменения переносятся сами.
Эту интеграцию GitHub и Stepik можно запустить в Scriptera: опишите задачу словами — сценарий соберут, запустят и будут следить, чтобы он работал.